In 1536 ziet de eerste uitgave van Calvijns Institutie (in het Latijn) in Bazel het licht. Nu vertrekt Calvijn uit Bazel; hij zou niet lang hierna zich onverwachts in Genève gaan vestigen.
De Institutie zou zijn beroemdste boek worden. Tussen 1536 en 1559 heeft hij eraan geknipt en geplakt totdat hij helemaal tevreden was.